↑ «Erling Haaland named April Player of the Month! ↑ «Erling Haaland named Bundesliga Player of the Month for November». Haaland además ha impulsado el pique entre Nike -su marca tienda betis personal de botas y que vista a la selección de Noruega- y Puma -patrocinador del Dortmund-. El 14 de noviembre de 2014, jugó contra Armenia también por la clasificación para la Eurocopa, donde anotó el único tanto del partido que le dio la victoria a su selección. La temporada de 2001-02 comenzó con una victoria en la Copa Intercontinental ante Boca Juniors de Argentina, pero acabó sin otro trofeo. Ese resultado envió al equipo de Múnich a la final de la Liga de Campeones una década después. ↑ «El Valencia volvió a perder una final (2001)». RTVE. Una temporada más tarde el Bayern conquistó su cuarto doblete, dirigiendo la liga por un margen estrecho. La siguiente temporada el equipo continuaba con un rendimiento regular y tras la jornada 10 donde el Bayern fue derrotado 5:1 por el Eintracht Fráncfort, Kovač fue despedido, asumiendo el cargo como interino Hans-Dieter Flick.
La primera temporada de Niko Kovač no empezó muy bien, ya que el Bayern se quedó atrás del Borussia Dortmund en la liga durante la primera mitad de la temporada. Finalmente el Bayern acabó nuevamente la temporada sin títulos, al perder las finales de Copa —5:2 ante el Borussia Dortmund— y Liga de Campeones —por penaltis—. Las derrotas adicionales en la Copa de Alemania y en la Copa de la Liga dejaron al club sin trofeos. La temporada 2015-16 empezó con derrota en la Supercopa de Alemania 2015 ante el Wolfsburgo en tanda de penales. El Bayern terminaría la campaña, faltando tres partidos de liga, alcanzando su quinto título consecutivo de Bundesliga tras vencer 0:6 al Wolfsburgo. No obstante cerca de finalizar el partido lograron vencerlos con marcador de 2:1. El 22 de septiembre, Robert Lewandowski fue autor de los cinco goles con los que el Bayern derrotó al Wolfsburgo en un partido válido por la liga. En la temporada de 2010-11 fueron eliminados en la ronda de octavos en la Liga de Campeones de la UEFA 2010-11 nuevamente por el Inter de Milán por la citada regla de goles fuera de casa. En la Liga de Campeones de la UEFA el club fue eliminado por el Liverpool en los octavos de final, siendo la primera vez desde 2011 que el Bayern no llegaba a la instancia de cuartos de final.
Van Gaal logró reconducir la situación y llevar al Bayern a los octavos de final de la Liga de Campeones, donde tuvieron a la Fiorentina como su adversario. El 6 de octubre la directiva del club confirmó el regreso de Jupp Heynckes hasta el final de temporada iniciando así su cuarta etapa como entrenador del Bayern. Poco más tarde, el Bayern conquistó la Liga de Campeones de la UEFA por cuarta vez después de una brecha de 25 años, derrotando al Valencia en la final en la tanda de penaltis. En 1960, el equipo se convirtió en campeón alemán por primera vez desde 1928, derrotando al 1. FC Colonia por 3-2 en la final del campeonato. El 6 de abril, el Bayern se proclamó campeón de liga por 23.ª vez en su historia, a falta de seis jornadas para el final, tras una victoria por 0:1 ante el Eintracht Fráncfort. Kahn en una conferencia de prensa.
El reinado de Hitzfeld acabó en 2004, a causa de esto el Bayern perdió desempeño, incluyendo una derrota en la Copa de Alemania contra el Alemannia Aquisgrán —equipo de la 2. Bundesliga—. Guardiola culmina con la conquista de la Copa de Alemania 2015-16, venciendo en la tanda de penaltis al Borussia Dortmund, camiseta borussia dortmund logrando así otro doblete. El 18 de mayo el Bayern ganó su séptimo título consecutivo en la 1. Bundesliga al terminar dos puntos por encima del Borussia Dortmund. El Borussia Dortmund se mostró muy firme el año pasado en su posición de no traspasar a Jadon Sancho. El equipo mejora en la Bundesliga 2011-12 pero solo le da para ser subcampeón tras el Borussia Dortmund. El 5 de agosto, el Bayern ganaría la Supercopa de Alemania 2017 por sexta vez, en una tanda de penaltis contra el Borussia Dortmund. La camiseta del Borussia Dortmund de esta temporada 2020/2021 rinde homenaje a este hito. Antes de la temporada 2011-12, fue promovido al primer equipo de forma permanente y se le asignó el número 22 en la camiseta. También, el equipo consiguió diez victorias en los primeros diez partidos de liga para registrar otro récord. Simplemente continuidad. El Dortmund me está ofreciendo esos partidos que necesito para crecer como jugador.